MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanocaldococcus fervens AG86 chromosome

Total Repeats: 35176

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_013156	GTA	2	6	165520	165525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810144
4003	NC_013156	GGAA	2	8	165582	165589	50 %	0 %	50 %	0 %	256810144
4004	NC_013156	TAT	2	6	165653	165658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810144
4005	NC_013156	A	7	7	165731	165737	100 %	0 %	0 %	0 %	256810144
4006	NC_013156	AT	3	6	165746	165751	50 %	50 %	0 %	0 %	256810144
4007	NC_013156	ATA	2	6	165766	165771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810144
4008	NC_013156	TAT	2	6	165782	165787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810144
4009	NC_013156	GAA	2	6	165791	165796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810144
4010	NC_013156	TGA	2	6	165843	165848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810144
4011	NC_013156	GAA	2	6	165901	165906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810144
4012	NC_013156	TA	3	6	166191	166196	50 %	50 %	0 %	0 %	256810145
4013	NC_013156	A	7	7	166196	166202	100 %	0 %	0 %	0 %	256810145
4014	NC_013156	ATG	2	6	166204	166209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810145
4015	NC_013156	A	6	6	166253	166258	100 %	0 %	0 %	0 %	256810145
4016	NC_013156	TCA	2	6	166341	166346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810145
4017	NC_013156	GAA	2	6	166368	166373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810145
4018	NC_013156	TGT	2	6	166381	166386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810145
4019	NC_013156	CT	3	6	166407	166412	0 %	50 %	0 %	50 %	256810145
4020	NC_013156	AGA	2	6	166435	166440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810145
4021	NC_013156	AAG	2	6	166502	166507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810145
4022	NC_013156	AGA	2	6	166538	166543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810145
4023	NC_013156	AATG	2	8	166544	166551	50 %	25 %	25 %	0 %	256810145
4024	NC_013156	T	6	6	166557	166562	0 %	100 %	0 %	0 %	256810145
4025	NC_013156	TTC	2	6	166581	166586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810145
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4027	NC_013156	AG	3	6	166594	166599	50 %	0 %	50 %	0 %	256810145
4028	NC_013156	GA	3	6	166685	166690	50 %	0 %	50 %	0 %	256810145
4029	NC_013156	CAC	2	6	166737	166742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256810145
4030	NC_013156	A	6	6	166845	166850	100 %	0 %	0 %	0 %	256810145
4031	NC_013156	CCA	2	6	166916	166921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256810145
4032	NC_013156	CAT	2	6	166945	166950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810145
4033	NC_013156	CAT	2	6	167019	167024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810145
4034	NC_013156	CAT	2	6	167135	167140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810145
4035	NC_013156	ATGT	2	8	167225	167232	25 %	50 %	25 %	0 %	256810145
4036	NC_013156	TGGAT	2	10	167240	167249	20 %	40 %	40 %	0 %	256810145
4037	NC_013156	AAG	3	9	167256	167264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810145
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4039	NC_013156	CAG	2	6	167359	167364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256810145
4040	NC_013156	ATG	2	6	167383	167388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810145
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4043	NC_013156	AGA	2	6	167735	167740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810146
4044	NC_013156	TTG	3	9	167768	167776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810146
4045	NC_013156	A	7	7	167800	167806	100 %	0 %	0 %	0 %	256810146
4046	NC_013156	TAA	2	6	167813	167818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810146
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4049	NC_013156	AATA	2	8	167976	167983	75 %	25 %	0 %	0 %	256810146
4050	NC_013156	TTG	2	6	168023	168028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810146
4051	NC_013156	TAAA	2	8	168062	168069	75 %	25 %	0 %	0 %	256810146
4052	NC_013156	AGG	2	6	168104	168109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810146
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4054	NC_013156	GAG	2	6	168234	168239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810146
4055	NC_013156	T	6	6	168249	168254	0 %	100 %	0 %	0 %	256810146
4056	NC_013156	AT	3	6	168282	168287	50 %	50 %	0 %	0 %	256810146
4057	NC_013156	ATA	2	6	168291	168296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810146
4058	NC_013156	TTTA	2	8	168315	168322	25 %	75 %	0 %	0 %	256810147
4059	NC_013156	CT	3	6	168323	168328	0 %	50 %	0 %	50 %	256810147
4060	NC_013156	TCA	2	6	168376	168381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810147
4061	NC_013156	AT	3	6	168386	168391	50 %	50 %	0 %	0 %	256810147
4062	NC_013156	TTA	2	6	168440	168445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810147
4063	NC_013156	TC	3	6	168535	168540	0 %	50 %	0 %	50 %	256810147
4064	NC_013156	CAA	2	6	168572	168577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810147
4065	NC_013156	CAT	2	6	168653	168658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810147
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4067	NC_013156	TGA	2	6	168762	168767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810147
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4070	NC_013156	T	6	6	168828	168833	0 %	100 %	0 %	0 %	256810147
4071	NC_013156	TCT	2	6	168910	168915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810147
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4076	NC_013156	GCAT	2	8	169137	169144	25 %	25 %	25 %	25 %	256810147
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4094	NC_013156	TCTT	2	8	170058	170065	0 %	75 %	0 %	25 %	256810148
4095	NC_013156	T	7	7	170116	170122	0 %	100 %	0 %	0 %	256810148
4096	NC_013156	T	6	6	170133	170138	0 %	100 %	0 %	0 %	256810148
4097	NC_013156	T	6	6	170155	170160	0 %	100 %	0 %	0 %	256810148
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4101	NC_013156	TAAC	2	8	170443	170450	50 %	25 %	0 %	25 %	256810149
4102	NC_013156	CA	3	6	170479	170484	50 %	0 %	0 %	50 %	256810149
4103	NC_013156	AT	3	6	170544	170549	50 %	50 %	0 %	0 %	256810149
4104	NC_013156	TCC	2	6	170603	170608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810149
4105	NC_013156	ATTTC	2	10	170625	170634	20 %	60 %	0 %	20 %	256810149
4106	NC_013156	CT	3	6	170645	170650	0 %	50 %	0 %	50 %	256810149
4107	NC_013156	TCC	2	6	170732	170737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810149
4108	NC_013156	AAC	2	6	170753	170758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810149
4109	NC_013156	GCATCA	2	12	170760	170771	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	256810149
4110	NC_013156	AACA	2	8	170825	170832	75 %	0 %	0 %	25 %	256810149
4111	NC_013156	T	6	6	170837	170842	0 %	100 %	0 %	0 %	256810149
4112	NC_013156	TTG	2	6	170848	170853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810149
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4120	NC_013156	ATT	2	6	171243	171248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810149
4121	NC_013156	T	6	6	171296	171301	0 %	100 %	0 %	0 %	256810149
4122	NC_013156	CAA	2	6	171328	171333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810149
4123	NC_013156	ATGT	2	8	171366	171373	25 %	50 %	25 %	0 %	256810149
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4125	NC_013156	ATGG	2	8	171405	171412	25 %	25 %	50 %	0 %	256810149
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4242	NC_013156	GATA	2	8	175578	175585	50 %	25 %	25 %	0 %	256810155
4243	NC_013156	CAA	2	6	175622	175627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810155
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4247	NC_013156	AAAAT	2	10	175735	175744	80 %	20 %	0 %	0 %	256810155
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